Archive des Bibliothèques universitaires de Nantes

Modifications iatrogènes du microbiote intestinal : impact de la chimiothérapie

Par : Montassier, Emmanuel

Document archivé le : 29/04/2015

La diarrhée post-chimiothérapie est un effet secondaire fréquent en cancérologie. Elle peut mettre en jeu le pronostic vital. Cependant, la physiopathologie de la diarrhée post-chimiothérapie est à ce jour mal connue et l'impact du microbiote intestinal dans la survenue de la diarrhée n'est pas rapporté à ce jour. L'objectif de notre travail était de décrire les modifications du microbiote fécal survenant au cours de la chimiothérapie et de rechercher des caractéristiques du microbiote fécal prédisposant à la survenue d'une diarrhée. Nous avons inclus 36 patients ayant un lymphome non-hodgkinien et recevant une même chimiothérapie de conditionnement. La flore fécale a été analysée par pyroséquençage. Les séquences ont été analysées avec QIIME. Douze (33%) patients ont développé une diarrhée sévère, dans un délai médian de 13 jours. Nos résultats montrent qu'il y a une diminution de l'alpha-diversité au cours de la chimiothérapie, et que cette diminution est encore plus marquée chez les patients ayant une diarrhée sévère. L'analyse de la béta-diversité sépare en 3 groupes distincts les échantillons collectés avant la chimiothérapie, les échantillons collectés après la chimiothérapie des patients n'ayant pas de diarrhée sévère et les échantillons collectés après la chimiothérapie des patients ayant une diarrhée sévère (p<0,001). L'analyse discriminante linéaire rapporte que le genre Bacteroides est significativement associé à la survenue d'une diarrhée post-chimiothérapie sévère alors que les genres Escherichia, Atobopium, Oribacterium, Anaerococcus, Blautia, Mogibacterium, Bifidobacterium sont significativement associés à l'absence de survenue d'une diarrhée. Notre étude a permis de faire un inventaire complet des modifications du microbiote fécal survenant au cours de la chimiothérapie et a montré qu'il est possible de prédire la survenue d'une diarrhée sévère par l'analyse d'un prélèvement de selles collecté en médiane 6 jours plus tôt. 14NANT01-VS

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