Étude génétique de la résistance aux carbapénèmes chez Pseudomonas aeruginosa
Par : Cady Anne
Document archivé le : 30/05/2008
Nous avons étudié les mécanismes de résistance aux carbapénèmes chez Pseudomonas aeruginosa. Le séquençage du gène oprD de 13 souches cliniques résistantes à l'imipénème a révélé le polymorphisme de ce gène et la difficulté d'interprétation des mutations observées dans ce contexte. Nous avons alors travaillé sur 6 couples de souches de colonisation digestive présentant une différence de sensibilité à l'imipénème. Pour 4 patients sur 6, la souche résistante a été isolée après administration d'imipénème. Les souches d'un même couple présentaient le même pulsotype. Par séquençage du gène oprD, nous avons détecté, pour chaque souche résistante, un événement génétique absent chez la souche sensible et conduisant à une porine OprD très modifiée ou absente. La RT-PCR n'a pas décelé de différence de transcription d'oprD entre souches sensibles et résistantes. En plus de la modification structurale de OprD, nous avons mis en évidence par RT-PCR, 5 souches hyperexprimant le système d'efflux MexAB-OprM et une souche hyperproductrice de la céphalosporinase AmpC. Enfin, nous avons souhaité savoir si les données concernant la contribution du zinc dans la résistance aux carbapénèmes, in vitro, pouvaient avoir un réel impact in vivo. Nous avons donc sélectionné 16 souches de P. aeruginosa de sensibilité diminuée à l'imipénème, isolées à partir d'urines sur sondes à demeure. Pour ces dernières, nous avons recherché, par séquençage, la mutation V194L dans le gène codant pour la protéine senseur CzcS. Nous n'avons retrouvé cette mutation chez aucune des souches.
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