Étude des miARNs dans le lymphome folliculaire
Par : Decaux, Aurélie
Document archivé le : 15/12/2014
Les miARNs sont de petits ARNs non-codants régulant la prolifération, la différenciation et l'apoptose cellulaire, suggérant leur étroite implication avec les processus cancéreux. Le lymphome folliculaire (LF), le plus fréquent des lymphomes indolents, dérive de cellules B du centre germinatif. L'objectif de cette étude est d'établir et de corréler le profil d'expression des miARNs (miRNome) à celui des ARNm (transcriptome) des cellules tumorales du LF, afin de mieux comprendre les processus de la tumorogénèse. 6 échantillons de LF, issus de ganglions, et 4 échantillons de centrocytes, issus d'amygdales saines, ont été triés par FACS. Le miRNome a été obtenu par séquençage (Illumina HiSeq2000, Integragen, Evry) et le transcriptome par hybridation sur puces Affymetrix HGU133plus2.0. Les données ont été analysées par le logiciel miRanalyzer et Partek GS. Dans nos populations de LF, 49 miARNs soit 4.3% de l'ensemble des miARNs exprimés, sont significativement dérégulés en comparaison aux centrocytes (t-test, FDR, p<0.05). La majorité de ces miARNs sont sous-exprimés (86%) dans le LF, parmi ceux-ci, on retrouve les membres du cluster 17-92, réputé oncogène dans d'autres types de cancers. Parmi les miARNs sur-exprimés dans le LF, les plus dérégulés sont le miR-26 et le miR-29. Pour cela, notre attention s'est focalisée sur les miR-26, miR-29 et sur le cluster 17-92. L'une des cibles communes à ces 3 familles de miARNs, d'après le logiciel TargetScan, est PTEN. Cette protéine, retrouvée sous-exprimée dans notre cohorte de LF, est impliquée dans la régulation de la voie PI3K/ AKT, voie favorisant la survie et la prolifération cellulaire. La dérégulation des miARNs pourrait faire partie des mécanismes épigénétiques impliqués dans la tumorogénèse du LF
14NANT046P
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