Évolution des techniques de séquençage, et exemples d'applications en microbiologie clinique

Par : Marchand, Sarah

Document archivé le : 26/01/2023 00:00

Il y a une cinquantaine d'années, le développement par Sanger et al. d'une technique de séquençage de l'ADN a permis de décrypter des génomes dans tous les domaines du vivant dont celui de l'Homme, et a ainsi révolutionné la biologie. Depuis le milieu des années 2000, le développement des technologies de séquençage de deuxième génération (NGS, next generation sequencing) a fait chuter le coût du séquençage à haut débit et l'a mis à la portée des laboratoires de biologie médicale. Puis, le récent déploiement de méthodes dites de troisième génération ou long-read a offert de nouvelles possibilités de séquençage. Utilisées dans un premier temps pour la recherche, le champ d'application potentiel de ces technologies à haut débit s'étend désormais au diagnostic médical et apporte de nouvelles approches diagnostiques et pronostiques pour certaines pathologies comme celles infectieuses. Cette thèse bibliographique vise à exposer de façon synthétique les principales technologies de séquençage de l'ADN, de la première à la troisième génération, avec pour chacune un descriptif schématisé et détaillé de son fonctionnement. Boite à outils puissante pour l'exploration des génomes, son utilisation croissante en microbiologie clinique permet d'identifier et de caractériser des agents pathogènes potentiellement responsables de maladies infectieuses. Ainsi, la dernière partie de cette thèse expose les différentes stratégies et applications possibles du séquençage de l'ADN en microbiologie clinique. 22NANT065P