Archive des Bibliothèques universitaires de Nantes

Champignons filamenteux contaminant l'environnement industriel pharmaceutique : Intérêts et limites des méthodes d'identification actuelles

Par : Delahaye, Thomas

Document archivé le : 06/09/2018

Les champignons filamenteux représentent un risque de contamination avéré en environnement industriel pharmaceutique. Pour un site de production, cette contamination représenterait jusqu'à soixante isolats par an. Les genres les plus fréquemment rencontrés sont Aspergillus, Cladosporium et Penicillium. Ces contaminations peuvent engendrer des conséquences plus ou moins importantes pour l'industriel et pour le patient. L'enjeu pour l'industriel est donc l'identification fiable et efficace du champignon filamenteux, contaminant son environnement, afin de mettre en place des actions correctives adaptées. Plusieurs stratégies peuvent être envisagées. Ainsi, quatre approches d'identification sont présentées dans ce document : les approches phénotypiques, génomiques, protéomiques et métabolomiques. Pour chacune d'elle, une méthode spécifique est présentée et illustrée d'exemples permettant de mettre en avant les intérêts et les limites respectifs. Ce travail a permis de mettre en exergue la complexité de l'identification des champignons filamenteux dans les environnements industriels pharmaceutiques. Il n'existe pas, en effet, une méthode d'identification fiable à 100%. Ceci est d'autant plus vrai pour les genres assez complexes contenant de nombreuses espèces comme c'est le cas pour les genres Aspergillus et Penicillium. A l'heure actuelle, seule l'utilisation complémentaire de différentes approches peut permettre d'obtenir le maximum d'informations convergentes qui pourraient fiabiliser les résultats d'identification. Ce constat doit donc être pris en considération par les industries pharmaceutiques qui pourraient être confrontées à des contaminations fongiques. 18NANT021P

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