Archive des Bibliothèques universitaires de Nantes

Comparaison de quatre protocoles d'identification bactérienne par spectrométrie de masse directement à partir d'hémocultures positives

Par : Thomin, Jean

Document archivé le : 10/07/2015

Les bactériémies demeurent, aujourd'hui, un problème de Santé publique majeur, en raison de la mortalité et du surcoût qu'elles engendrent. La précocité et la qualité de l'antibiothérapie, particulièrement en cas de sepsis sévère, apparaissent comme primordiales dans ce contexte. L'objectif de notre étude a été d'optimiser la prise en charge des hémocultures au sein du Service de Bactériologie du C.H.U. de Nantes, afin de fournir aux cliniciens des résultats microbiologiques le plus rapidement possible. Dans ce but, nous avons mis au point puis testé quatre protocoles, permettant une identification bactérienne rapide, directement à partir des hémocultures, grâce à la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight Mass Spectrometry). Au cours de l'étude, un total de 944 cultures de sang a été testé. 58,5 %, 73,4 %, 80,4 % et 83 % d'identification correcte à l'espèce bactérienne ont été obtenus, respectivement, avec les protocoles 1, 2, 3 et 4, pour les hémocultures monomicrobiennes. Il est intéressant de noter que 99 % des identifications MALDI-TOF directes obtenues étaient correctes au niveau d'espèce. Parmi les 45 hémocultures polymicrobiennes testées, une identification précise à l'espèce a été obtenue pour une des deux bactéries présentes dans 33,3% des cas (n=15). Les 30 autres hémocultures polymicrobiennes n'ont donné aucun résultat. Le protocole 4, combinant centrifugation rapide et acide formique, apparaît comme le plus efficace, autant dans les performances d'identification bactérienne que dans la rapidité d'exécution. Sa rapidité d'exécution (environ 15 minutes), sa grande concordance avec les techniques d'identification de routine et son faible coût sont prometteurs dans l'optique d'une utilisation en routine, lors du diagnostic des bactériémies au laboratoire. 15NANT011P

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