Génétique des malformations cardiaques congénitales : apport de la technique de puces à ADN génomique (Comparative Genomic Hybridisation ; aCGH)
Par : Sánchez Castro, Marta
Document archivé le : 21/09/2015
Notre projet a consisté à analyser par aCGH 316 patients présentant une malformation cardiaque congénitale (MCC)à type de transposition des gros vaisseaux, tétralogie de Fallot ou coarctation de l’aorte avec pour objectif la détection de microdélétions et microduplications génomiques et ainsi l’identification de nouveaux gènes contribuant à ces MCC. L’identification de nouveaux gènes permet une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires et embryologiques à l’origine de ces malformations et un meilleur conseil génétique. Notre étude a conduit à l’identification de 21 microdélétions et 50 microduplications rares de novo ou héritées dont certaines comprennent des gènes candidats aux MCC. L’analyse bioinformatique des données a permis de montrer que de nombreuses microdélétions/microduplications comprennent des gènes possédant des sites de fixation de FOXC1. Ces microdélétions/microduplications pourraient donc altérer l’expression de certains gènes régulés par FOXC1 au cours du développement cardiaque. Par ailleurs, parmi les remaniements identifiés, nous avons détecté une délétion d’environ 1Mb en amont de SOX9 chez des patients avec malformation cardiaque et syndrome de Pierre Robin.Nous avons montré que cette délétion comprend plusieurs activateurs cardiaques putatifs. Ces résultats suggèrent que la dérégulation de SOX9 peut être responsable de MCC. Enfin, nous avons identifié une duplication partielle de la région 5’ du gène SEMA3D donnant lieu à un ARNm tronqué de SEMA3D. Ces résultats suggèrent que la portion tronquée de SEMA3D pourrait perturber la migration des cellules de la crête neurale au cours du développement et ainsi contribuer aux MCC.
14NANT40-VS
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